Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps1O08983 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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