Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms