Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms