Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms