Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms