Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm8356J3QPD3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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