Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms