Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3336J3QMQ6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3336J3QMQ6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3336J3QMQ6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3336J3QMQ6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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