Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20834J3QM72 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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