Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf148G3X9R7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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