Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms