Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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