Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28048F7BCN0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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