Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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