Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms