Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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