Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1bF6V0H0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms