Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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