Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm28305F6U473 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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