Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Urb2E9Q7L1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms