Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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ApobE9Q414 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
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