Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms