Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ryr1E9PZQ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms