Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms