Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp839E9PUU5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp839E9PUU5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp839E9PUU5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp839E9PUU5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp839E9PUU5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp839E9PUU5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms