Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms