Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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