Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf217D3YYI7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf217D3YYI7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf217D3YYI7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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