Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms