Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms