Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smok3bC0HKC9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smok3bC0HKC9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smok3bC0HKC9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smok3bC0HKC9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smok3bC0HKC9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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