Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms