Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia1B2RXQ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms