Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms