Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rd3lB2RV38 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rd3lB2RV38 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms