Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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