Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms