Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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