Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Atp8b5A3FIN4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Atp8b5A3FIN4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp8b5A3FIN4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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