Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rnf39A2RT81 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms