Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms