Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms