Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SetxA2AKX3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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