Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms