Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prdm12A2AJ77 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prdm12A2AJ77 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prdm12A2AJ77 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms