Protein–RNA interactions for Protein: A2A5R2

Arfgef2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef2A2A5R2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef2A2A5R2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef2A2A5R2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms