Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5114W4VSN8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5114W4VSN8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms