Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Homer1Q9Z2Y3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Homer1Q9Z2Y3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158 ms