Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptgdr2Q9Z2J6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptgdr2Q9Z2J6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms