Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K7

Apc2, Adenomatous polyposis coli protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apc2Q9Z1K7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apc2Q9Z1K7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apc2Q9Z1K7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apc2Q9Z1K7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms